百合的种子采集一般果期8～10月，当蒴果呈黄色时采收，摊晾数日待其开裂，取出种子，筛簸去瘪粒和小种子，放阴凉处保存，种子不耐贮藏，贮藏半年后发芽率很低，只有百分之几的发芽率。
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可以将挖出来的百合鳞球茎晾晒一天后放于干燥的河沙中埋藏，也可用报纸包装外再包一塑料袋，置于干燥的场所，温度要保持在510℃之间。
百合属于多年生球根草本植物。
百合会在花后长出蒴果，果里种子较多，大体是薄片状的，成熟后即播出苗率会高一些，但出苗较慢，由小苗生长为小鳞茎，再由小鳞茎长成大鳞茎才会开花，所以很少采用，而利用大鳞茎上分生的小鳞茎繁殖比较简单，种源较少时还可以采用鳞片繁殖，有个别品种叶腋会长出珠芽，也能用来繁殖。
百合想要留种要在开花期人工授粉，等长出果实且完全成熟后采摘下来，取出种子，放在低温、干燥的地方保存，等来年进行播种即可。百合不容易接种，且它的种子比较小，含的养分有限，萌发率低，很少能长成健壮的植株，因此一般不用播种法进行繁殖，通常都是用分株法繁殖的，成活率高且生长速度快。
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