目前辣椒嫁接栽培所用砧木主要为抗病野生辣椒、半栽培辣椒，品种数量较少，主要砧木品种有
（1）适合尖椒类品种嫁接用砧主要有“PFRK64”、“PFRS64”、“LS279”等砧木品种。（2）适合甜椒类品种嫁接用砧主要为“土佐绿B”砧。
另外，一些茄子嫁接用砧木，如超抗托巴姆、红茄等，在各地所作的辣椒嫁接栽培试验中，也取得了理想的效果。
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目前辣椒嫁接栽培所用砧木主要为抗病野生辣椒、半栽培辣椒，品种数量较少，主要砧木品种有
（1）适合尖椒类品种嫁接用砧主要有“PFRK64”、“PFRS64”、“LS279”等砧木品种。（2）适合甜椒类品种嫁接用砧主要为“土佐绿B”砧。（3）其他砧木一些茄子嫁接用砧木，如超抗托巴姆、红茄等，在各地所作的辣椒嫁接栽培试验中，也取得了理想的效果。
目前，辣椒嫁接栽培技术主要应用于保护地辣椒防病栽培中，要求所用嫁接砧木不仅抗病性能好，而且还不能降低辣椒果实的品质。具体要求如下
（1）高抗辣椒土壤传播病害要求所用砧木品种对辣椒疫病、根结线虫病高抗或高耐病，并且抗病性稳定，不因栽培时期以及环境条件变化而发生改变。就目前辣椒生产形势来看，预防辣椒疫病和根结线虫病应是所选砧木所必备的条件。（2）与辣椒的嫁接亲和力和共生力强而稳定要求与辣椒嫁接后，嫁接苗成活率不低于80%，并且嫁接苗定植后生长稳定，不出现中途夭折现象。（3）不改变果实的形状和品质要求所用砧木品种与辣椒嫁接后不改变果实的形状和颜色，不出现畸形果。
（4）不削弱植株的生长势，也不造成植株徒长。
目前，辣椒嫁接栽培技术主要应用于保护地辣椒防病栽培中，要求所用嫁接砧木不仅抗病性能好，而且还不能降低辣椒果实的品质。具体要求如下
（1）高抗辣椒土壤传播病害要求所用砧木品种对辣椒青枯病、根腐病、根结线虫病等高抗或高耐病，并且抗病性稳定，不因栽培时期以及环境条件变化而发生改变。就目前辣椒生产形势来看，预防辣椒疫病和根结线虫病应是所选砧木所必备的条件。（2）与辣椒的嫁接亲和力和共生力强而稳定要求与辣椒嫁接后，嫁接苗成活率不底于80%，并且嫁接苗定植后生长稳定，不出现中途夭折现象。（3）不改变果实的形状和品质要求所用砧木品种与辣椒嫁接后不改变果实的形状和颜色，不出现畸形果。
（4）不削弱植株的生长势，也不造成植株徒长。
嫁接辣椒的时候，可以使用半栽培辣椒、野生辣椒作为砧木，对于甜椒类的辣椒，砧木可使用的品种为土佐绿B，对于尖椒类的品种，砧木可用PFR-S64、PFR-K64以及LS279。辣椒嫁接也可以选择其他的茄科植物上，比如茄子等。在准备嫁接前，要先消毒剪刀，这样植株不容易感染病菌。
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