黄瓜烂根其病菌主要侵染根及地表上茎部，初呈现水浸状，后腐烂。茎部缢缩不明显，病部腐烂处的维管束变褐，不向上发展，后期病部往往变糟，留下丝状维管束。病株地上部初期症状不明显，后叶片中午萎蔫，早晚尚能恢复。严重的则多数不能恢复而枯死。病菌主要从根部伤口侵入，后在病部产生分生孢子，借雨水或灌溉水传播蔓延，进行再侵染。高温、高湿利其发病，连作地、低洼地、下水头发病重，由于最近连续下雨，在加上高湿和熏蒸是其发病的主要原因。
防治方法可用5甲基硫菌灵按每亩～克随水浇灌。
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当下黄瓜的大部分死棵问题，都是由底肥或者水溶肥烧根，进而引发病原菌侵染造成的，因此要特别注意肥料的选择和使用。肥料烧根典型症状分为底肥烧根和追肥伤根。苗子定植后下部叶片黄化干枯，生长迟缓。拔出后根系变褐腐烂，无新根，这是底肥烧根。浇水追肥后出现叶片发黄、萎蔫，甚至新叶、瓜条等部位出现块状黄斑，拔出根系发现新根少，根系发黄，为追肥伤根。高发季节换茬底肥用量大、追肥质量不佳预防措施1.针对底肥问题一是合理配肥，提前发酵。避免使用未腐熟的粪肥，推荐使用发酵鸡粪、发酵羊粪等，替代未经腐熟的稻壳粪、干鸡粪等，或者歇茬期提前施用到土壤中，浇水后结合高温闷棚，发酵腐熟粪肥，并杀灭粪肥中可能携带的鸡虱子、地蛆等病虫害。二是深翻土壤。粪肥用量大时，增加土壤翻耕深度，避免粪肥集中在地表，也可以有效减轻烧根可能。发酵鸡粪2.针对追肥问题一是追肥多烧根时，及时摘除瓜条，减轻植株负担，并喷洒氮磷钾及氨基酸叶面肥；二是使用枯草芽孢杆菌、哈茨木霉菌等生物菌剂灌根，防止伤根后侵染根部病害，并养护好根系。治疗措施一是连续大水漫灌，稀释有害物质，促进粪肥发酵。二是随水冲施三是冲施功能性促根肥，调节根系活性，如沃家福海藻酸、甲壳素等，促进新根再生。除此之外，引发黄瓜死棵的另外一个主要原因就是黄瓜根腐病。黄瓜根腐病根腐病典型症状易在主根、较大侧根发生，病株的根茎部及根部皮层呈淡褐色及深褐色腐烂，极易剥离，露出木质部，横切茎观察，可见维管束变褐色。高发时期冬春预防措施一是提早蘸根、灌根，定植时用化学药剂或者生物菌剂蘸根，定植后在病害高发期灌根预防。二是连续冲施生物菌剂养根，如农药证号的枯草芽孢杆菌、哈茨木霉菌等，或者自主发酵的生物菌肥，如归源农法系列。根腐病治疗措施药剂灌根，化学药剂配方3克露500倍。化学药剂灌根后，间隔510天，随水冲施枯草芽孢杆菌、哈茨木霉菌等，巩固防治效果。黄瓜死棵直接影响农户的收益，带来的损失是巨大的，针对这个问题提前预防是关键。已经发生后也勿惊慌，防治结合，合理用药，将损失降到最低。
如果钙肥不足，黄瓜吸收不到足够钙肥，就会出现缺钙症状，生长点叶片组织发软，最终会导致细菌感染出现烂头。所以平时可以叶面喷施钙肥，促进叶片对钙肥的吸收速度，同时复配细绵腐病瓜发病后瓜上长出浓密的白色菌丝、从瓜前端开始腐烂，湿度大时病部长出白色绵毛、即病原菌菌丝体，本病也可引起死秧，平均气温22~28度、连阴雨天多、或湿度大利于发病。
种植黄瓜造择光照充足、通风位置良好的地块，可以降低土壤湿度，不利于病菌、虫卵生长。使用充分发酵好的农家有机肥，进行深翻掺加土壤中，为植株释放充足的的肥力，促进生长，黄瓜枯萎病主要是由于黄瓜根部被病菌感染，该病菌可能来源于未腐烂成熟的农家肥。我们有的时候在使用农家肥时，没有去在意其腐熟程度，从而导致我们施肥时用了未腐熟的农家肥。
黄瓜种植完后，要施以基肥，基肥对黄瓜的生长发育非常关键，它的施肥量占全肥量的一半，而且需要一次性施足，但是施肥也有技巧，为了更好的发挥肥料的作用和根部的吸收，我们需黄瓜苗期猝倒病幼苗露出地表的胚芽基部或中部呈水浸状，后变成黄褐色干枯缩为线状，往往子叶未凋萎而幼苗猝倒。有的瓜苗出土胚轴和子叶腐烂，变褐枯死。
根腐病防治:初期可用代森锰锌、硫酸铜、恶霉灵等杀菌剂，兑水进行喷施。发病时可用甲基托布津、甲霜恶霉灵、硫酸铜、多菌灵，进行根部灌根，隔十天再冲施一次，在作物好转时进行解决办法:如果您是用盆栽种植蔬菜，建议查看一下盆栽底部，是否留有小孔，如果没有，请在盆子底部(拿锤子用钉子钻几个小孔)，这样可以改良土壤湿度(盆栽一定要注意排水)。
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