荆芥、芥穗功能相似，常相互代用。
1)荆芥是全草，它味辛、微温，药性比较平和，归属肺和肝经。善治风邪症，是发表散风之常用药。它具有发表散风，透疹疗疮又有止痛解痛之功效，适用风寒症或风热表证、麻疹不透、头风头痛、风疹瘙痒以及疮疡初起又挟有表证的人。
2)荆芥穗的药效与荆芥基本相同，只是它的发汗力比荆芥大，药力也较强，也适用于荆芥所治的病症，但如果根据病情需要加强药力的话就用它代替荆芥。
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荆芥穗与荆芥的区别是
一、形态不同
荆芥株高我0厘米，叶叶卵状至三角状心脏形，长2.57厘米，宽2.14.7厘米。花序为聚伞状，下部的腋生。荆芥穗为品穗状轮伞花序呈圆柱形，长3～15厘米，直径为7毫米。
二、产地不同
荆芥出产地为西南、中部一带地区，人工栽培主产安徽、江苏、浙江、江西、湖北、河北等地。而荆芥穗产自中国各个地方上，其中以江苏、浙江、江西为主生长地。
三、作用不同
荆芥既可食用又可药用，主治于感冒发热、头痛、麻疹，风疹，还可治跌打损伤，咽喉热痛等效用。荆芥穗主要是治感冒，头痛，麻疹，风疹，疮疡初起等病症。
四、食用不同
荆芥有强烈香味，能以鲜嫩的茎叶供作蔬菜食用。另外还可以凉拌菜吃，是一种经济效益高、很有发展前途的无公害、保健型辛香蔬菜。而荆芥尽可作为药材用，香味稍微淡一点。
荆芥味平，性温，无毒，清香气浓，辛散气香，长于发表散风，且微温不烈，药性缓和，为发散风寒药中药性最为平和。
入药用其干燥茎叶和花穗。
茎方形微带紫色，横切面黄白色，
穗子稍黑紫黄绿色。
药性上没有太大的区别，药房里荆芥穗和荆芥都有，不过荆芥穗的药性更平和而已~
这要从两味药的性质来分
荆芥与香薷同属于发散类药物，但是作用却不完全相同。
荆芥味辛、性微温，有发汗解表的作用。配防风、苏叶，用于辛温解表；配薄荷、银花、桑叶，用于辛凉解表；配防风、当归、川芎、苏梗，用于产后受风。荆芥与其他辛温解表药不同的是风寒、风热的表证，都可以应用。
荆芥还可以透疹、止痒、治皮肤病。配蝉衣、葛根、薄荷等，可治麻疹不易透出；配赤芍、苍术、黄柏、白藓皮、苦参等，可治风疹、湿疹、疥、癣等。
荆芥兼能清血分伏热，有理血止血作用。配地榆、槐花炭，可用于治疗便血；配藕节、黑山栀、白茅根，可治衄血；配当归、益母草、棕炭、川断炭，可治月经过多、崩漏、产后失血；配红花，可行恶血等。用于止血时，须炒炭用。
本品茎穗同切生用，称荆芥；只用其穗称生芥穗；炒炭用时，称荆芥炭、芥穗炭。荆芥适用于散全身的风邪；生芥穗适用于散头部的风邪；荆芥炭和芥穗炭适用于止血，并可治疗产后失血过多和血晕症。选用哪一种，处方时要写清楚。
荆芥能祛血中之风，故为风病、血病、疮病、产后病的常用药。荆芥善治皮里膜外，及血脉之风邪。防风善治骨肉之风邪。
用量一般是3～9克。治产后失血而血晕时，可用芥穗炭30克，单味水煎服。
服用荆芥时，不要食鱼、蟹、河豚、驴肉。
香薷味辛，性微温，能解表祛暑化湿，利水消肿。主治夏季感冒暑湿的表证，症见恶寒发热、头痛、无汗、身痛或腹痛，吐泻等。常与荷叶、扁豆、佩兰、藿香等同用。并可用于治疗水湿浮肿，小便不利者（如急性肾炎浮肿等）。扁豆健脾化湿而消暑；荷叶升达清气而消暑，香薷散利湿浊而祛暑。
冬季伤寒的表证，解表用麻黄；夏季伤暑的表证，解表用香薷。
用量一般为3～6克，体壮病重者也可用9克。
体弱易出虚汗者忌用。
荆芥穗是后者这种植物的一部分，是属于它的花穗部分，花序呈圆柱形，长度大约3-15厘米左右。荆芥是唇形科、荆芥属的多年生草本植物，地上部分晒干后入药。两者是都能入药使用的，但是荆芥穗的功效更多，能包含荆芥的功效，虽然是药物，但是两者都不能随便使用，需要事先询问医生。
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